各種組蛋白
2014-04-23 11:30 來源：http://www.szyajie.com/ 閱讀： 次破譯“組蛋白密碼”識別新機制
圖1. a) 組蛋白H3.3K36me3被ZMYND11串聯Bromo-ZnF-PWWP結構域識別；b)組蛋白H3“K4me3-R8me2a”被Spindlin1串聯Spin/Ssty結構域組合識別。
1）
發表在《天然》上的論文在原子水平精致闡釋了一種腫瘤抑制因子ZMYND11應用其串聯“Bromo-ZnF-PWWP”構造域識別組蛋白變體H3.3K36me3修飾的分子機制（圖1a）。功能實驗與生物信息學剖析進一步表明ZMYND11通過辨認組蛋白H3.3K36me3修飾，在轉錄延長程度抑制了腫瘤發生相干基因的適度表白，進而克制腫瘤產生。該論文首次揭示誕生物體內存在組蛋白變體特異的甲基化識別蛋白。這種對組蛋白變體和甲基化潤飾類型的雙重識別，是組蛋白修飾識別機制上的新亮點，體現了真核生物表觀遺傳調控的龐雜性和主要性。本論文是在清華大學李海濤實驗室，美國德克薩斯大學安德森癌癥核心的施曉冰助理傳授實驗室以及美國貝勒醫學院的李蔚助理教學實驗室的通力合作下實現的。全部研究涵蓋了結構生物學、細胞生物學，和功效基因組學等內容，充足體現了當前性命迷信研究中多學科深度穿插的趨勢。作為獨特通信作者，李海濤課題組負責論文中的結構生物學跟生物物理聯合試驗局部。李海濤課題組博士后李元元為本文共同第一作者，實驗室研討助理任永峰參加了該項工作。
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發表在《基因與發育》雜志上的論文報導了Spindlin1蛋白特異識別一種新型組蛋白甲基化修飾組合H3“K4me3─R8me2a”的分子結構基礎，并結合細胞生物學研究，探討了該識別在結腸癌Wnt信號通路中的激活調控作用（圖1b）。Spindlin1是Spin/Ssty家族成員之一，參與細胞周期的調控，在多種腫瘤中高表達。結構研究表明Spindlin1分離通過串聯Spin/Ssty結構域2和1特異性識別組蛋白H3K4me3和H3R8me2a甲基化修飾；利用等溫量熱滴定法測定該識別的結合常數高達45納摩爾，是目前已報導的結協力最強的組蛋白修飾識別事件，充分顯示了組蛋白修飾多價態識別的潛力。清華大學醫學院李海濤特別研究員和生命科學院吳畏教授是本論文共同通訊作者；醫學院2010級博士研究生蘇曉楠和生命科學學院博士后朱貴欣為該論文共同第一作者；清華大學生命科學院2010級本科生（清華學堂班）學生丁霄哲同窗是本論文第三作者。本論文協作研究小組還包括美國密歇根大學竇亞麗副教授，北京生命科學研究所的朱冰研究員等。
清華消息網3月4日電 清華大學醫學院基本醫學系和結構生物學中央李海濤課題組日前在國際威望學術期刊《做作》（Nature, 2014年3月2日）和《基因與發育》（Genes & Dev，2014年3月3日）在線發表兩篇論文，從結構生物學角度解析組蛋白甲基化修飾識別新機制，進一步揭開盤根錯節的表觀遺傳調控（epigenetic regulation）的神秘面紗。
清華李海濤課題組在《自然》和《基因與發育》持續發文
真核生物基因表達調控不僅依附于特定的DNA 序列元件，而且還受到特定組蛋白翻譯后修飾的精細調節。目前鑒定出的組蛋白修飾化學類型已超過25種，包含甲基化，�；�，磷酸化等。這些組蛋白修飾及其組合被以為構成一組狹義上的“組蛋白密碼”，是表觀遺傳調控的重要機制之一。此外，各種組蛋白（H1，H2A, H2B，H3和H4）還廣泛存在不同的序列變體。組蛋白變體和組蛋白修飾賦予組蛋白宏大的信息荷載才能，介入形成一層超出DNA序列的表觀遺傳信息，在染色質結構調節及基因抒發調控等進程中起著要害作用。目前發明良多疾病與組蛋白修飾異樣有著十分重要的關系，因而研究組蛋白修飾的發生，打消以及讀取機制，對深刻懂得基因功能調控機制以及疾病的發生和醫治等都有側重要意思。
李海濤博士于2010年1月受聘為清華大學醫學院特殊研究員，重要從事結構表觀遺傳學研究。他曾于2007年與配合者洛克菲勒大學C. David Allis教授一起在《自然綜述：分子細胞生物學》（Nat Rev Mol Cell Biol 8: 983-994）撰寫綜述正式提出組蛋白修飾的多價態組合識別學說；并于2011年分辨在《自然-結構分子生物學》（Nat StructMolBiol 18: 769-776）（通訊作者）和《細胞》（Cell 145： 692-706）（第二作者）雜志發表論文報導人類ATRX綜合征蛋白特異識別組蛋白H3“K4me0-K9me3”甲基化修飾組合，以及人類BPTF蛋白在核小體水平特異識別組蛋白H3甲基化和H4乙�；揎椊M合的研究成果。本次工作是時隔兩年多后，李海濤課題組在組合型組蛋白修飾識別方面作出的新沖破。相關研究結果不僅有助于揭示組蛋白修飾調控和人類疾病與健康的關聯，也為后續表觀遺傳因子靶向的小分子藥物開發奠定了基礎。
供稿：醫學院 編纂：襄樺
以上研究得到科技部973打算，國度基金委天然科學基金，教導部新世紀優良人才方案，清華大學221人才規劃，中國博士后科學基金，清華-北大生命科學結合中央等贊助。衍射數據收集得到上海同步輻射光源以及北京同步輻射光源的鼎力支撐與幫助,清華總裁研修。
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